慈眼院大日如来坐像为慈眼院多宝塔内供奉的本尊，像高约70cm的寄木造（拼木雕）、漆箔装饰、是雕眼的大日如来。经过平成2年（1990年）的修理，重现了因漆箔受损的浅雕、少量的衣纹线、圆脸等藤原雕刻（定朝风格）的优美风姿。
坐像头部进深浅，两肩相拼，体现出平安时代（794～1185年）末期的制作技术，在那个时代，佛师（做佛像的手艺人）尚未成为一种职业，因此从中尚可以看出作品经过不断试错后最终完成的印迹。