延慶3年（1310）ごろに作成された荘園絵図「日根荘日根野村・井原村荒野開発絵図」に記されている岡本（現、南中岡本）には、船岡神社の境内地に船岡山があり、標高25.5ｍの小高い丘です。今は陸地の中にある船岡山が、古くは海岸線との境にあったといわれており、日根神社の御旅所であったといわれています。
式内社である日根神社の由来を記した文書によると、神功皇后じんぐうこうごうが異国退治に行った際、新羅しらぎ国皇太子で「日根明神ひねみょうじん」（日根宮）の化身でもあった正覚太子しょうがくたいしが神功皇后の軍を助けました。そして皇太子が神功皇后と共に船で岡本浦に到着したとき、雷電が轟き、大雨が降りました。そこで乗ってきた船を埋めて鎮めたそうです。そこが「船岡山」であり、翌年４月２日に神功皇后はこの場所に詣でたことから、以降４月２日に大祭を行われるようになりました。大祭時には船岡山へ神輿渡御をし、神楽が行われ、競馬を行うとあります。

このように日根神社と船岡山は深く関わっており、現在でも５月４日と５日にまくらまつりが行われており、戦前までは船岡山への渡御とぎょも行われていたことがわかっています。