慈眼院は寛文かんぶん5（1665）年に京都仁和寺にんなじから今の院号を賜り、古くから隣の日根神社（大井関大明神おおいせきだいみょうじん）の神宮寺じんぐうじとして、多宝塔、金堂を持つ由緒ある寺院です。棟札むなふだは、各施設の建立や修復に関わる記録で、これまでの修理経過や携わった職人名などが知ることができます。現在20枚の棟札むなふだが残されていて、もっとも古い享禄きょうろく3（1530）年の「・・・瓦替法華寺一宇？？？？」から昭和26（1951）年の多宝塔屋根替修理までと日根神社本殿の建立に関わる慶長けいちょう7（1602）年の棟札むなふだ3枚が含まれています。