犬鳴山有葛城系修驗寺院七寶瀧寺，該寺於齋明天皇7年（661年），由修驗道的開山鼻祖役行者在28歲時創建。位於入山田村的船淵村山中，以所在地犬鳴山為山號。另外山內由七寶瀧（瀑布名），以此為寺號。南北朝時代（1336～1392年）志一上人和南朝方的橋本正督等人復興了寺院，戰國時代（1467～1573年）根來寺僧成為七寶瀧寺別當（官職名稱），歸入根來寺的管轄。九條政基於文龜2（1502）年11月在日根莊停留，從別當真福院真海處借來「七寶瀧寺緣起」並抄寫下來的抄本依然保留在九條家，由此抄本可知寺廟的淵源。根據資料記載，役行者看到深山中瀑布岩石上出現了不動明王，落下歡喜的眼淚，開墾山頭荒地，建立了一字草堂，雕刻出所出現的神像並作為本尊供奉。另外山中有7條瀑布，這是「七寶充滿智水（洗去煩惱之意）」，因此以此作為寺號。

曾經是根來寺分寺（聖護院末），天台系的寺僧曾管轄過犬鳴山，但現在是真言宗犬鳴派本山。『政基公旅引付』中有記載 「犬鳴山」、「七寶瀧寺」的名稱及子院（坊院）的阿彌陀坊、西坊、武藏坊的名稱。九條政基有記述於文龜2（1502）年8月和泉下守護的被官佐藤久信等人的軍隊攻打上之鄉、日根野西方、土丸之時曾在西坊避難，以及犬鳴山寺僧在火走神社等祈雨的情形。犬鳴山的開山比大和的大峰山早6年，因此被稱為元山上。另外還被稱為葛城峰中奧之院，在文龜2（1502）年的『犬鳴山緣起』中也被記載為第8個修行場。境內有長祿3（1459）年銘文的石板碑。

「另外，這座山中流傳著許多有趣的傳說。據說天德年間（957～960年），紀州池田莊名為山田某的獵人曾在葛城山中追趕鹿隻。正準備拉弓射箭之際，隨行的狗兒突然叫出聲，嚇跑了獵物。因此獵人十分生氣，割下了狗頭，飛起的狗頭卻咬住了正要襲擊獵人的大蛇，獵人得以平安。為祭奠救助自己而死的狗兒，獵人選擇出家。聽了這個永遠弔唁愛犬的故事，宇多天皇讚賞其為「報恩義犬」，故賜名犬鳴山。」（摘自犬鳴山七寶瀧寺官網）